Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ehd3Q9QXY6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms