Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC17Q9NP64 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC17Q9NP64 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms