Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod4Q9JLH8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmod4Q9JLH8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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