Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CtsmQ9JL96 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms