Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms