Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd9Q9D9M4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd9Q9D9M4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd9Q9D9M4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd9Q9D9M4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd9Q9D9M4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd9Q9D9M4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd9Q9D9M4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd9Q9D9M4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd9Q9D9M4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd9Q9D9M4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Pdzd9Q9D9M4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd9Q9D9M4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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