Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms