Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PclafQ9CQX4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PclafQ9CQX4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms