Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8VDP2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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