Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt25Q8VCW2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms