Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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