Protein–RNA interactions for Protein: Q8K119

Pms1, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms1Q8K119 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pms1Q8K119 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pms1Q8K119 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms