Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc113Q8C5T8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms