Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms