Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms