Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ubash3bQ8BGG7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ubash3bQ8BGG7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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