Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms