Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms