Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms