Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nom1Q3UFM5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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