Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rpusd2Q149F1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rpusd2Q149F1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rpusd2Q149F1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Rpusd2Q149F1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Rpusd2Q149F1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd2Q149F1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rpusd2Q149F1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms