Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou6f1Q07916 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms