Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms