Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms