Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms