Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TnikP83510 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TnikP83510 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TnikP83510 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TnikP83510 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TnikP83510 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TnikP83510 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TnikP83510 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TnikP83510 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TnikP83510 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TnikP83510 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TnikP83510 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TnikP83510 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TnikP83510 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TnikP83510 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TnikP83510 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TnikP83510 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TnikP83510 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TnikP83510 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TnikP83510 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TnikP83510 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms