Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms