Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Sh3bp1P55194 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Sh3bp1P55194 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Sh3bp1P55194 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Sh3bp1P55194 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Sh3bp1P55194 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Sh3bp1P55194 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sh3bp1P55194 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sh3bp1P55194 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sh3bp1P55194 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sh3bp1P55194 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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