Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtshP49935 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtshP49935 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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