Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms