Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18528 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18528 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18528 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18528 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18528 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18528 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18528 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18528 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18528 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18528 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
P18528 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18528 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms