Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb1P17919 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms