Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb1P12658 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Calb1P12658 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Calb1P12658 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb1P12658 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Calb1P12658 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Calb1P12658 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Calb1P12658 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Calb1P12658 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Calb1P12658 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Calb1P12658 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb1P12658 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb1P12658 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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