Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Defa1P11477 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms