Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms