Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms