Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Per1O35973 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Per1O35973 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Per1O35973 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Per1O35973 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Per1O35973 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Per1O35973 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Per1O35973 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Per1O35973 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Per1O35973 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Per1O35973 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Per1O35973 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Per1O35973 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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