Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec22bO08547 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms