Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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