Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20878L7N244 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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