Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc180J3QNE4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms