Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms