Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms