Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm6880A3KG45 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm6880A3KG45 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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