Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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