Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn7Q9Z261 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn7Q9Z261 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn7Q9Z261 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn7Q9Z261 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cldn7Q9Z261 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cldn7Q9Z261 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cldn7Q9Z261 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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