Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms