Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snapc3Q9D2C9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms