Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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