Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms